黄帝称帝不久，长江流域也涌现出一个比较强大的部族，叫“九黎”部族。
“九黎”部族的首领叫蚩尤，兄弟八十一人，个个能征善战，强悍凶猛，善使刀、戟、弓、弩等锋利武器。加之蚩尤性残暴，喜搏斗，见炎帝自渭水南下，他便率部族北上，与炎帝争抢地盘，大战于陈州。
这一仗惊天地、吓鬼混，炎帝本是一个小部落，力不能敌九黎，只好败走山东曲阜。
蚩尤追至曲阜，炎帝又败退到河北孤泉，蚩尤继续追击，炎帝又逃往涿鹿。
此时涿鹿已是黄帝部族的势力范围，见亲哥哥被九黎杀得丢盔卸甲便派使者说服炎帝归顺，炎帝因恨父迁怒于弟不听劝说，反而与黄帝大战于孤泉。
被兵之将不可再战，遇到黄帝率领的劲旅，结果是三战三败，为了将是生命，炎帝只好统部下归顺黄帝，订盟于邙山，共讨蚩尤。
黄帝亲自带兵出战，率领以熊、罴、貔、貅、貙、虎为图腾的六个部落，向蚩尤猛攻。
传说蚩尤是“铜头铁额，食沙吐火”，生性嗜杀好战，而且力大无穷，神功盖世，一般人难以制胜。
可是他遇到了黄帝，黄帝部族在发展农牧业的同时，早已发展了采矿和冶炼，平时操练兵马用的都是铁制的干戈，所以对蚩尤一点也怕。他率领强悍的有熊国熊兵猛将，团团把蚩尤大军围住；双方展开了有史以来的大拼杀。
蚩尤眼见杀得难解难分，就施展魔法，从鼻孔喷出团团浓雾，刹时天昏地暗，狂风大作，雷电交加，一直延续了三天。黄帝的部众一时都迷失了方向，分不清东南西北，军心开始浮动。
蚩尤的部众则精神大振，乘势凶猛冲杀。黄帝当即命令风后制作了一辆指南车，车上站着一个铁制的小人，伸出手臂指向南方。黄帝部众立刻辨明了方向，六大部落顿时情绪激昂，奋力冲出重雾，直杀得九黎部族“尸横遍野，血水漂杵”，最终擒杀了蚩尤。
黄帝战败蚩尤后，长江流域的其他部族纷纷归顺黄帝，黄帝便在釜山大会天下诸侯被推举为天子，完成了统一中华的不朽功勋。
在此同时制定了华夏民族统一的图腾标帜，也就是旗帜。当时有人建议仍以有熊部族的“熊”为图腾，黄帝否定了这个建议。他认为，以“熊”为图腾将伤害新归顺的各部族的感情。为了团结这些部族，他提出以蛇为主体，以鱼鳞为鳞，以龟尾为尾，以狮头为头，以鹿角为角，以鹰爪为爪，并命名这个表示各个部族大团结的新图腾叫“龙”。
黄帝三十岁才结婚，他选妃重在功德，而不讲容貌。
他有四个妻子，元妃嫘祖发明了植桑、养蚕。次妃嫫母发明了朝缫丝、织布。在她们的倡导下，人们逐渐摆脱了以树叶、兽皮遮体的原始生活，穿上了柔软、温暖、华丽的衣裳。
黄帝很重视人才，他命仓颉造字，命伯高采矿炼铜，命宁封子制陶器，命赤将做木器、釜灶，命邑夷制车，命共鼓制舟楫，命容戎定历法，命隶首兴算数，命令伦选音律，命荣猿铸钟，命歧伯与雷公编医经，还有宫室、器皿、棺椁等许多发明。人类从此完结了长期蛮荒愚昧的状态，逐步过渡到文明之中，能以高度的勤劳与智慧发明创造出那些先进的生产、生活工具。
黄帝有二十五个儿子
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